Kladogenesis adalah proses evolusi yang menyebabkan pemisahan spesies dalam pohon filogenetik. Peristiwa ini biasanya terjadi ketika beberapa organisme berada di wilayah yang baru dan jauh atau saat peristiwa lingkungan menyebabkan kepunahan dan membuka relung ekologi baru bagi mereka yang bertahan. Contoh kladogenesis adalah beberapa organisme liar yang mencapai Kepulauan Hawaii melalui arus dan angin samudra. Sebagian besar spesies di kepulauan tersebut tidak dapat ditemui di tempat lain di Bumi akibat pemisahan evolusioner.
Kladogenesis merupakan lawan dari anagenesis, yaitu perubahan gradual dalam spesies nenek moyang yang membuatnya digantikan oleh bentuk yang baru (dalam kata lain tidak ada "pemisahan" dalam pohon filogenetik).
- Korotayev, Andrey (2004). World Religions and Social Evolution of the Old World Oikumene Civilizations: A Cross-cultural Perspective (edisi ke-First Edition). Lewiston, New York: Edwin Mellen Press. ISBN 0-7734-6310-0. (on the applicability of this notion to the study of social evolution).