| Protein REV terikat pada RRE mRNA | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Ditunjukkan di atas adalah kompleks RNP yang dibentuk oleh HIV-1 REV yang mengikat RRE pada mRNA gen env. Yang disorot dalam slate adalah ARM dari domain pengikatan RNA, sedangkan yang berwarna hijau adalah mRNA dengan struktur seperti loop batang sekunder (PDB 4PMI).
| |||||||||
| Identifikasi | |||||||||
| Simbol | REV | ||||||||
| Pfam | PF00424 | ||||||||
| InterPro | IPR000625 | ||||||||
| SCOP | 484d | ||||||||
| SUPERFAMILY | 484d | ||||||||
| |||||||||
Rev adalah sebuah protein transaktivasi yang penting untuk regulasi ekspresi protein HIV-1 (dan lentiviral lainnya). Sinyal lokalisasi nuklir dikodekan dalam gen rev, yang memungkinkan protein Rev dilokalisasi ke nukleus, di mana ia terlibat dalam ekspor mRNA yang tidak disambung dan tidak disambung tidak lengkap. Dengan tidak adanya Rev, mRNA dari gen akhir (struktural) HIV-1 dipertahankan dalam nukleus.
Sejarah
Sebuah protein baru ditemukan terlibat dalam terjemahan gag dan env mRNA. Protein yang tidak diketahui berfungsi dengan menghilangkan represi dari urutan pengaturan dan diberi nama Art (transaktivator anti-represi). Studi selanjutnya menunjukkan bahwa protein terlibat dalam regulasi mekanisme penyambungan RNA. Oleh karena itu, nama protein diubah dari Art menjadi Trs (transregulator splicing). Penelitian terbaru menunjukkan bahwa protein memiliki banyak fungsi dalam regulasi protein HIV-1, dan namanya telah diubah menjadi Rev (pengatur ekspresi protein virion), yang secara lebih umum menggambarkan fungsinya.
Struktur
Rev adalah protein 13-k Da yang terdiri dari 116 asam amino. Urutan Rev berisi dua domain spesifik yang berkontribusi pada impor dan ekspor nuklirnya.
Motif kaya arginin
Wilayah N-terminal Rev berisi urutan kaya arginin. Motif kaya arginin (ARM) terletak di antara asam amino 38-49 dari gen rev dan membentuk struktur sekunder alfa-heliks. ARM adalah urutan yang sangat spesifik yang memungkinkan multimerisasi protein Rev, sebelum pengikatan RNA. Substitusi basa tunggal mengubah kemampuan Rev untuk membentuk tetramer. Domain Rev yang kaya arginin berinteraksi dengan elemen rev-binding (RBE), yang merupakan bagian dari elemen respons HIV Rev (RRE) yang terletak di hilir intron gen env. Struktur sekunder alfa-heliks secara khusus dapat dianggap sebagai motif helix-loop-helix, yang memungkinkan protein REV untuk mengikat secara stabil ke RRE RNA untuk membentuk kompleks ribonukleoprotein. Domain juga berisi sinyal lokalisasi nuklir.
Domain aktivasi rev (Sinyal ekspor nuklir)
Sinyal ekspor nuklir Rev terletak di residu 71-82 dari wilayah terminalus-C dan kaya akan leusin.