KEGG

KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) adalah kumpulan database yang berkaitan dengan genom, pathway biologi, penyakit, obat, dan bahan kimia. KEGG digunakan untuk riset dan pengajaran bioinformatika, termasuk analisis data dalam genomika, metagenomika, metabolomika dan studi omika lainnya, perancangan model dan simulasi dalam sistem biologi, serta riset translational dalam pengembangan obat.

Sejarah

Proyek database KEGG dimulai pada tahun 1995 oleh Minoru Kanehisa, Professor pada Institute for Chemical Research, Kyoto University, yang saat itu berada di bawah Human Genome Program Jepang. Menurut para developernya, KEGG merupakan suatu "computer representation" dari sistem biologi.

• Informasi sistem
  • PATHWAY—peta pathway untuk fungsi-fungsi seluler dan organismal
  • MODULE—modul atau unit fungsional gen
  • BRITE—klasifikasi hierarkis entiti biologi
• Informasi genomik
  • GENOME—genom lengkap
  • GENES—gen dan protein dalam genom lengkap
  • ORTHOLOGY—group ortologi gen dalam genom lengkap
• Informasi kimia
  • COMPOUND, GLYCAN—senyawa kimia dan glikan
  • REACTION, RPAIR, RCLASS—reaksi kimia
  • ENZYME—nomenklatur enzim
• Informasi kesehatan
  • DISEASE—penyakit manusia
  • DRUG—obat yang sudah diberi izin
  • ENVIRON—obat mentah dan bahan terkait kesehatan

Lihat pula

• Comparative Toxicogenomics Database - CTDintegrates KEGG pathways with toxicogenomic and disease data
• ConsensusPathDB, a molecular functional interaction database, integrating information from KEGG
• Gene ontology
• PubMed
• Uniprot
• Gene Disease Database

Pranala luar

Wikidata memiliki sebuah properti, P665, untuk KEGG IDs (lihat penggunaan)

• KEGG website
• GenomeNet mirror site
• The entry for KEGG Diarsipkan 2012-04-02 di Wayback Machine. dalam MetaBase